中草药是一种理想的天然、环保的绿色药物，来源广，成本低，同时其疗效慢，作用时间长，并且不易产生抗药性，能够加速水产动物的生长发育，增强其体质，提高免疫力和抗应激能力。
1.大黄：每万尾鱼种用大黄粉末0.4公斤左右，煎汁或用热开水浸泡一夜，过滤去渣，将汁液拌入饵料投喂，连喂5天，可防治草鱼出血病。
2.大蒜：每100公斤鱼体用大蒜0.5～1公斤，捣成蒜泥拌入饵料投喂，连喂6天，可防治烂鳃、肠炎鱼病。若加入等量食盐，可提高其作用。
3.韭菜：每亩水深1米的鱼池用韭菜2.5公斤，切碎后加入食盐0.2公斤，拌入饵料投喂，连喂3天，可防治鱼类肠炎病。
4.水花生：每1000公斤鱼体用水花生50公斤，打成浆后加入12公斤食盐，搅匀，再拌入150公斤面粉，制成丸状药饵，每天一次，连喂3天，可防治草鱼出血病。
5.生姜：将适量鲜姜捣碎，取姜汁直接涂抹于鱼体伤口处，可杀菌、解毒、杀虫、消炎。每亩水深1米的鱼池，用生姜0.25公斤切碎，放入炼熟的0.75公斤菜油锅中，继续炼20分钟，待油冷却后加适量水搅拌均匀，然后全池泼洒，每日一次或隔日一次，连泼两次，可防治草鱼烂腮、肠炎并发症。
6.苦楝：每亩水深1米用马尾松、苦楝树叶、皮或果各10～12.5公斤，切碎熬汁成12～25公斤，全池泼洒，每日一次，连用2～3天。取苦楝树枝叶30～40公斤，直接在池中堆沤，5～7天后捞出残渣，能有效防治寄生虫性腮病，及锚头蚤、中华蚤、毛细线虫、车轮虫、隐鞭虫病等。
7.芦苇：每万尾鱼种用芦苇根5公斤，加大蒜0.25公斤和食盐0.25公斤，打成浆，拌喂或制成药饵，每天2次，连喂4～6天。可防治草鱼肠炎病。
8.水菖蒲：每亩水深1米，用切碎的菖蒲4～5公斤，用蓖麻叶4～5公斤，裹在10公斤左右的松树叶上，扎成2～3捆，放置于食场及上风口进水处，浸没在水中，每天翻动一次，促使其腐烂。可防治肠炎、赤皮、烂腮、水霉病等。
9.桑树叶：每0.15亩用鲜桑树叶1公斤，与苦楝树皮1公斤，鲜菖蒲2公斤，混合捣烂，再加碎饼2公斤拌匀，全池泼洒，可防治鱼锚头蚤病。
10.鲜松针：每亩鱼池用15～20公斤鲜松针扎成10个小捆，悬挂在食台周围水面下，或将鲜松针捣碎，加水20公斤浸泡一昼夜，连汁带渣全池均匀泼洒，可防治鱼类锚头蚤病。
11.马齿苋、地锦草：取鲜嫩马齿苋、地锦草切碎后直接投喂，可主治肠炎病。
12.铁苋菜：铁苋菜、水辣蓼各2公斤，加水20公斤，煎煮2小时，取汁拌饵料投喂，一天一次，连喂3天，用来防治草、青鱼细菌性肠炎病。
13.石榴皮：每百斤鱼用干石榴皮0.15公斤碾成粉拌饵料投喂，每天2次，连用5天；或每亩水深1米用5～8公斤煎汁全池泼洒，治疗鳃隐鞭虫、车轮虫病。
14.柳树枝：每亩水面用鲜柳树叶10～15公斤，扎成捆投放水中，树叶烂了再换一次。可治草鱼肠炎病、烂鳃病和赤皮病。
15.辣椒：每亩（水深1米）水面用干辣椒0.21公斤加0.07公斤生姜加10公斤水，一起煎煮后，再加入15公斤冷水，全池泼洒，连用两次，治疗鱼类小瓜虫病效果明显。
16.艾叶：每亩水深1米，用干艾叶10公斤或鲜艾叶30公斤加水60公斤，文火煎至30公斤，全池泼洒，每天一次，连用3～5天，防治草鱼赤皮病。